西暦2085年、巨大隕石が地球に衝突。
政府は宇宙へ逃亡し、人類は見捨てられた。隕石の衝撃で海面は急上昇し、大地の大半が水没。文明は崩壊し、地球は滅亡の淵に立たされた。
しかし、海に取り残された旧時代の軍艦とわずかな兵士たちは、最後まで戦うことを決意する。だが、その矢先、宇宙人の攻撃が激化。隕石はただの天災ではなく、彼らが地球を滅ぼすために送り込んだ兵器だった。圧倒的な戦力差に、人類は絶望的な状況へ追い込まれる。
だがその時、深い海の底から幽霊船が浮上する。かつて戦場で散った亡霊たちが、今、人類のために立ち上がったのだ。見捨てられた軍隊と亡霊たちが共闘し、地球の未来をかけた最後の戦いが始まる!